Més de la meitat del contingut dels fruits secs són lípids (greixos) amb predomini dels saludables àcids grassos insaturats: àcid oleic (en major quantitat en ametlles i avellanes) i àcid olinoleico (abundant en cacauets i nous). L'excepció és el coco, en què els greixos saturats són majoritaris. Els fruits secs són rics en àcids grassos essencials, que l'organisme humà és incapaç de sintetitzar i que resulten imprescindibles per la formació de membranes cel·lulars, particularment en les cèl·lules nervioses.

El contingut mineral dels fruits secs és superior al de la resta de fruites, i destaquen en magnesi, fòsfor, potassi, calci i ferro, i oligoelements com el zinc i el seleni (estos dos, amb acció antioxidant). Quant a les vitamines, manquen en general de vitamina C però són rics en B1 o tiamina, niacina o B3 i folats. I constituïxen una de les fonts vegetals més abundants en vitamina E. Però una part de la vitamina B1 i de l'E es destrueix en el procés de torrar. Aporten proteïna (ametlles, cacauets i llavors de girasol, més del 20%) i fibra en quantitats considerables, cosa que afavorix la mobilitat intestinal i combat el restrenyiment.